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L'un des principaux obstacles au traitement ou au développement d'un vaccin efficace contre le VIH est la grande diversité génétique du virus lui-même. Alors que les virus qui utilisent de l'ADN double brin pour se répliquer sont relativement stables, les rétrovirus comme le VIH reculent dans leur cycle de réplication (en utilisant l'ARN à une seule souche) et sont beaucoup moins stables. En conséquence, le VIH est très sujet aux mutations, en fait, environ un million de fois plus fréquemment que les cellules utilisant de l'ADN.À mesure que la diversité génétique du virus s'élargit et que différents sous-types viraux sont transmis d'une personne à l'autre, le matériel génétique mixte peut créer de nouveaux hybrides de VIH. Alors que la plupart de ces hybrides meurent, les quelques survivants présentent souvent une plus grande résistance au traitement du VIH et, dans certains cas, une progression plus rapide de la maladie.
La variabilité du VIH, par conséquent, crée une sorte de «cible mobile» pour les chercheurs, avec de nouvelles souches recombinantes (génétiques combinées) capables de résister ou d'échapper complètement aux agents neutralisants. Certaines, comme la souche A3 / 02 identifiée par des chercheurs suédois en 2013, sont capables d'épuiser les défenses immunitaires d'une personne de manière beaucoup plus agressive que les souches précédemment connues.
Que sont le VIH-1 et le VIH-2?
Il existe deux types de VIH: le VIH-1 et le VIH-2. Le VIH-1 est considéré comme le type prédominant, représentant la grande majorité des infections dans le monde, tandis que le VIH-2 est beaucoup moins répandu et principalement concentré dans les régions d'Afrique occidentale et centrale. Alors que ces deux types de VIH peuvent conduire au SIDA, le VIH-2 est beaucoup plus difficile à transmettre et beaucoup moins virulent que le VIH-1.
Au sein de chacun de ces types de VIH se trouvent un certain nombre de groupes, de sous-types («clades») et de sous-sous-types. Sans aucun doute, d'autres sous-types et souches recombinantes seront découverts à mesure que la propagation mondiale du VIH se poursuit.
Groupes et sous-types de VIH-1
Le VIH-1 est divisé en quatre groupes: le groupe M (signifiant «majeur»); Groupe O (signifiant «aberrant», ou au-delà où d'autres groupes sont vus); et Groupe N (signifiant «non-M» et «non-O»); et Groupe P (qui signifie «en attente»). Les quatre groupes différents sont classés selon les quatre différents virus de l'immunodéficience simienne (SIV) qui étaient connus pour être transmis des singes ou des chimpanzés à l'homme.
VIH-1 Groupe M
Le groupe M VIH-1 a été le premier à être identifié et représente aujourd'hui environ 90% des cas de VIH dans le monde et se trouve pratiquement dans toutes les régions de la planète. Au sein de ce groupe se trouvent 10 sous-types, qui peuvent être stratifiés, entre autres, en fonction de leur répartition géographique et de leur impact sur différents groupes à risque.
- Sous-type A: observé en Afrique de l'Ouest et affectant principalement les hétérosexuels et les consommateurs de drogues injectables (UDI).
- Sous-type B: le sous-type prédominant en Europe, dans les Amériques, au Japon, en Thaïlande et en Australie, représentant presque toutes les infections en Amérique du Nord et environ 80% de toutes en Europe. Les infections surviennent davantage chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) et les UDI que chez les hétérosexuels.
- Sous-type C: décrit comme le sous-type de VIH le plus répandu, représentant 48% de toutes les infections dans le monde, principalement hétérosexuelles et principalement en Afrique subsaharienne, en Inde et dans certaines parties de la Chine.
- Sous-type D: isoler principalement en Afrique orientale et centrale.
- Sous-type E: un sous-type vu uniquement sous forme recombinante avec le sous-type A.
- Sous-type F: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées en Afrique centrale, en Amérique du Sud et en Europe.
- Sous-type G: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées dans certaines régions d'Afrique et d'Europe.
- Sous-type H: parmi un plus petit pourcentage d'infections observées en Afrique centrale.
- Sous-type J: observé en Afrique du Nord, centrale et de l'Ouest et dans les Caraïbes
- Sous-type K: limité à la République démocratique du Congo (RDC) et au Cameroun.
VIH-1 Groupe O
Le VIH-1 groupe O a été découvert en 1990 et ne représente que 1% des infections dans le monde. Ce groupe VIH est isolé au Cameroun et dans les pays africains voisins.
VIH-1 Groupe N
Le VIH-1 groupe N a été découvert en 1998 et, encore une fois, n'a été observé qu'au Cameroun avec moins de 20 cas documentés à ce jour.
VIH-1 Groupe P
Le VIH-1 Groupe P est un type rare de VIH, identifié pour la première fois chez une femme du Cameroun en 2009. Il peut être différencié des autres groupes de VIH dans la mesure où ses origines ont été liées à une forme de SIV trouvée chez les gorilles occidentaux. Bien que la classification «P» visait à déduire un statut «en attente» (c'est-à-dire en attente de confirmation d'une infection supplémentaire), un deuxième cas documenté a été identifié en 2011 chez un Camerounais.
Groupes VIH-2
Bien que des cas de VIH-2 aient été identifiés ailleurs, les infections sont presque exclusivement observées en Afrique. Il existe actuellement huit groupes VIH-2, bien que seuls les sous-types A et B soient les seuls considérés comme épidémiques. On pense que le VIH-2 a croisé des espèces d'un type de SIV affectant le mangabeys de suie singe directement aux humains.
Le VIH-2 du groupe A est principalement observé en Afrique de l'Ouest, bien que les voyages internationaux aient conduit à une petite poignée de cas documentés aux États-Unis, en Europe, au Brésil et en Inde. En revanche, le groupe B du VIH-2 a été confiné à certaines parties de l'Afrique de l'Ouest.