Contenu
- Définir une culture croissante
- Types d'infections pouvant être diagnostiquées
- Types de cultures
- Ingrédients utilisés dans les cultures
Alors, qu'est-ce qu'une culture exactement et comment aide-t-elle à diagnostiquer une infection?
Définir une culture croissante
Une culture est une façon de cultiver un microbe dans un laboratoire. De nombreuses bactéries, champignons, parasites et virus peuvent être cultivés dans un laboratoire lorsque les conditions appropriées sont utilisées. Les caractéristiques précises de la culture en croissance peuvent être utilisées pour identifier le microbe spécifique. L'utilisation d'un «agent sélectif» peut être utilisée pour déterminer les caractéristiques du microbe. Par exemple, la croissance de Staph aureus dans une culture contenant de la méthicilline (l'agent sélectif) indiquerait une résistance à la méthicilline Staph aureus (SARM). La méthicilline est un type d'antibiotique, donc une bactérie qui se développe dans une culture contenant de la méthicilline résiste au traitement utilisant cet antibiotique spécifique.
Ces cultures sont généralement contenues dans des plaques ou des tubes qui contiennent des aliments spéciaux qui permettent à un pathogène particulier ou à un groupe d'agents pathogènes de se développer. Cela permet aux travaux de laboratoire d'identifier quel microbe se développe. Les travailleurs de laboratoire peuvent avoir besoin de cultiver le microbe sur plusieurs plaques (ou tubes) de culture différentes pour identifier exactement de quel microbe il s'agit. Cela peut être comme un casse-tête de détective Sherlock Holmes.
Types d'infections pouvant être diagnostiquées
Les cultures diagnostiques sont couramment utilisées pour identifier les microbes infectieux à partir d'échantillons isolés d'urine (infections des voies urinaires), de selles (diarrhée et maladies d'origine alimentaire), des voies génitales (MST), de la gorge (angine streptococcique) et de la peau (infections cutanées). Des échantillons isolés d'autres parties du corps, telles que le sang et la moelle épinière, peuvent également être mis en culture; ces types d'infections ont tendance à être plus graves et nécessitent une hospitalisation.
Types de cultures
Il existe trois principaux types de cultures:
Culture solide
Les bactéries et les champignons peuvent se développer sur une surface solide composée d'un mélange de nutriments, de sels et d'agar (un agent gélifiant isolé des algues). C'est souvent sur une assiette de la taille de votre paume. Beaucoup sont de petits plats avec du gel rouge, certains gels sont jaunes ou d'autres couleurs. Un seul microbe placé sur la surface solide peut se développer en colonies ou en groupes individuels composés de milliers de cellules. Les colonies sont constituées de clones, dans lesquels toutes les cellules sont identiques les unes aux autres. Cette caractéristique est ce qui rend les cultures solides si utiles pour l'identification microbienne. Différents types de colonies de diverses espèces auront des traits et des caractéristiques distincts (par exemple, la couleur, la taille, la forme et le taux de croissance de la colonie), qui aident les microbiologistes à identifier le microbe.
Culture liquide
Une culture liquide est cultivée dans des «milieux» ou un «bouillon» de nutriments. La croissance microbienne est observée pour la rapidité avec laquelle le bouillon devient trouble. Un bouillon plus trouble signifie généralement un plus grand nombre de microbes. Les cultures liquides peuvent souvent contenir plusieurs espèces microbiennes, elles ont donc tendance à être moins utiles que les cultures solides pour le diagnostic des bactéries et des champignons. Les cultures liquides, cependant, sont plus utiles pour le diagnostic des parasites, qui ne forment pas de colonies normales dans des cultures solides.
Culture de cellules
Certains microbes, tels que la chlamydia ou la rickettsie, et les virus ne peuvent pas être cultivés dans des cultures solides ou liquides, mais peuvent être cultivés dans des cellules humaines ou animales. Les cultures de cellules humaines ou animales sont utilisées en «infectant» la culture cellulaire avec le microbe et en observant l'effet sur les cellules. Par exemple, de nombreux virus ont des effets néfastes ou «cytopathiques» sur les cellules qui peuvent être observés par les microbiologistes. Étant donné que les méthodes de culture cellulaire ont tendance à être plus spécialisées et nécessitent plus de travail et des périodes de diagnostic plus longues, la culture cellulaire est généralement utilisée en second lieu à d'autres méthodes de diagnostic. Il peut être particulièrement difficile de faire pousser certains microbes.
Ingrédients utilisés dans les cultures
Selon le type particulier de culture, les ingrédients varient. De nombreux ingrédients différents sont utilisés, car ils peuvent être utilisés pour déduire où un microbe peut et ne peut pas se développer, identifiant ainsi ce qu'est le microbe. Cela ne nous en dit souvent pas beaucoup sur l'organisme lui-même, mais nous aide plutôt à déduire le nom de l'organisme. Chaque microbe a son propre goût particulier dans les gels de culture et les ingrédients. En général, la plupart des cultures nécessitent une combinaison des éléments suivants:
- Source d'amino-azote: protéines digérées
- Facteurs de croissance: sang, sérum ou extrait de levure
- Source d'énergie: sucres, glucides
- Sels pour tamponner le pH: phosphate, citrate
- Minéraux: calcium, magnésium ou fer
- Agents sélectifs: antibiotiques ou produits chimiques
- Indicateurs ou colorants: pour déterminer les niveaux d'acidité
- Agent gélifiant pour cultures solides: agar