Contenu
- Histoire d'Ebola
- Comment se produisent les mutations
- Génétique d'Ebola
- Preuve et débat actuels
- Surveillance et prévention
Ces dernières années, il a été suggéré que le virus Ebola mute rapidement et pourrait augmenter sa virulence (capacité d'infecter). Quelle est la gravité de ces préoccupations?
Histoire d'Ebola
La première épidémie connue d'Ebola est survenue au Soudan en juin 1976, bien que le virus n'ait été officiellement identifié qu'en août, date à laquelle il s'était propagé au Zaïre voisin (maintenant connu sous le nom de République démocratique du Congo). À ce moment-là, plus de 500 personnes étaient décédées avec un taux de mortalité supérieur à 85%.
La plus grande épidémie d'Ebola, affectant certaines parties de l'Afrique de l'Ouest, a fait plus de 11 000 morts et n'a officiellement pris fin qu'en mars 2016 après plus de trois ans de mesures agressives de lutte contre la maladie.
Depuis lors, il y a eu trois autres flambées: une en République démocratique du Congo (RDC) en 2017, une deuxième dans la province de l'Équateur de la RDC en 2018 et une troisième dans la province du Kivu en RDC à partir de 2018.
En 2019, l'épidémie du Kivu était officiellement devenue la deuxième plus grande épidémie de l'histoire, des rapports suggérant que la maladie était plus difficile à contenir en raison, en partie, de mutations qui augmentent la capacité du virus à infecter les cellules humaines.
Certains responsables de la santé préviennent que cela peut être un signe qu'Ebola devient plus virulent et finira par rompre le confinement en Afrique de l'Ouest. Bien qu'il existe des preuves historiques et épidémiologiques à l'appui de ces affirmations, il reste un débat considérable sur la question de savoir si ces mutations rendent réellement le virus plus infectieux.
Comment se produisent les mutations
En règle générale, tous les virus muter - des adénovirus qui causent le rhume jusqu'aux virus graves comme Ebola. Ils le font parce que le processus de réplication est sujet aux erreurs. À chaque cycle de réplication, des millions de virus défectueux sont produits, dont la plupart sont inoffensifs et incapables de survivre.
En virologie, une mutation est simplement l'altération du codage génétique d'un virus par rapport à celui du type naturel prédominant (appelé «type sauvage»). Les mutations ne signifient pas intrinsèquement qu'un virus «s'aggrave» ou qu'il y a une chance que le «nouveau» virus prédomine soudainement.
Avec Ebola, le fait même qu'il ait fait le saut d'infecter les animaux à l'homme indique qu'il a subi des mutations afin de survivre chez des hôtes humains.
Les preuves suggèrent fortement que les chauves-souris frugivores sont les espèces à partir desquelles le virus Ebola a été transmis aux humains.
Une fois le saut franchi, de nouvelles évolutions ont été nécessaires pour créer le virus que nous avons aujourd'hui: un virus qui ne peut se propager qu'entre les humains et pour lequel la transmission entre les animaux et les humains (et vice versa) n'est pas considérée comme possible.
Existe-t-il d'autres virus comme Ebola?Génétique d'Ebola
Ebola est un virus à ARN comme le VIH et l'hépatite C. Contrairement à un virus à ADN, qui s'infiltre dans une cellule et met en valeur sa machinerie génétique, un virus à ARN doit subir une conversion en ADN avant de pouvoir remplacer le codage génétique d'une cellule.
En raison de ces étapes supplémentaires (et du rythme rapide de réplication), les virus à ARN sont plus vulnérables aux erreurs de codage. Alors que la majorité de ces mutations ne sont pas viables, certaines peuvent persister et même prospérer. Avec le temps, les mutations les plus copieuses peuvent prédominer. C'est un processus naturel d'évolution.
De son côté, Ebola ne possède pas beaucoup d’informations génétiques. Il s'agit d'un virus monocaténaire d'une longueur d'environ 19 000 nucléotides (ce n'est pas beaucoup si l'on considère qu'un seul chromosome humain contient environ 250 millions de paires).
Malgré son impact massif, Ebola ne possède que sept protéines structurelles, dont chacune joue un rôle encore inconnu dans la manière dont la maladie est transmise, se réplique et provoque la maladie.
Une fois à l'intérieur du corps humain, Ebola peut se répliquer rapidement, créant des millions de virus par millimètre de sang en l'espace de quelques jours ou semaines. Avec un renouvellement aussi rapide, il y a beaucoup de place pour les erreurs de codage.
Ces erreurs peuvent potentiellement modifier le génotype (constitution génétique) et le phénotype (structure physique) du virus prédominant. Si un changement permet au virus de se lier et de s'infiltrer plus efficacement dans une cellule, il peut théoriquement augmenter l'infectivité (capacité à se propager), la pathogénicité (capacité à provoquer une maladie) et la virulence (gravité de la maladie) du virus.
Les preuves sont partagées quant à savoir si cela se produit déjà.
Le virus de Marburg est-il le prochain virus Ebola?Preuve et débat actuels
Contrairement à d'autres maladies transmissibles dans lesquelles la virulence d'un organisme augmente parallèlement à l'augmentation de la résistance aux médicaments, Ebola ne mute pas en réponse aux traitements car il n'y en a pas. Le traitement est principalement de soutien, impliquant des transfusions sanguines intraveineuses (IV), une hydratation orale et IV et un contrôle de la douleur. Bien qu'il existe plusieurs traitements expérimentaux qui peuvent aider à améliorer les résultats, aucun n'est capable de contrôler ou de neutraliser le virus.
En tant que tel, toute mutation du virus Ebola se produit dans le cadre de la sélection naturelle (processus par lequel des organismes mieux adaptés à un environnement peuvent survivre et produire une progéniture).
Aussi bénin que le processus puisse paraître, de nombreux experts craignent que l’évolution naturelle d’Ebola - telle qu’elle se transmet d’une personne à l’autre et, en tant que telle, à travers différents environnements uniques - augmente la «forme» du virus et fasse c'est d'autant plus difficile à contrôler et à traiter.
Les experts à l'appui de la théorie soulignent les épidémies antérieures au cours desquelles la propagation de la maladie était maîtrisée plus rapidement qu'aujourd'hui. Par exemple, l'épidémie de 1976 au Zaïre a été maîtrisée en seulement deux semaines. En revanche, l'épidémie de 2018 au Kivu a été déclarée urgence sanitaire mondiale en juillet 2019, les experts suggérant qu'elle pourrait prendre jusqu'à trois ans pour être maîtrisée.
En surface, des chiffres comme ceux-ci semblent suggérer que l'infectiosité d'Ebola a augmenté. Des mutations récemment identifiées dans le Virus Ebola (EBOV) - Génome de Makona (la tension causale en Afrique de l'Ouest) semblent soutenir davantage l'hypothèse.
Une étude publiée dans le numéro de mai 2018 de Rapports de cellule a depuis remis en question ces prétentions et démontré que toutes les mutations, même les plus importantes, ne sont pas intrinsèquement inquiétantes.
Résultats de recherche
Selon des recherches menées par l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID), les changements génétiques observés dans EBOV-Makona étaient, en fait, similaires à celles qui se produisent dans certaines souches virulentes du VIH. Cependant, contrairement à ceux impliqués avec le VIH, les mutations ne se sont pas traduites par une aggravation de la maladie.
En fait, lorsque la souche modifiée d'Ebola a été testée sur des souris, la progression de la maladie était en fait plus lente. Chez les singes macaques, la souche a présenté une pathogénicité réduite et n'a eu aucun effet sur l'excrétion virale (la libération de virus dans les fluides corporels qui augmente le risque de transmission).
Dans leurs conclusions, les chercheurs ont suggéré que d'autres facteurs pourraient expliquer les difficultés de contrôle de la maladie, y compris le statut immunitaire des populations vulnérables, les systèmes de santé médiocres et l'augmentation des déplacements et de la mobilité.
Les résultats du NIAID ont soutenu des recherches antérieures menées au Mali dans lesquelles les mutations identifiées d'Ebola ne semblaient pas augmenter l'aptitude du virus ou le rendre plus transmissible.
Surveillance et prévention
Le corpus actuel de preuves ne devrait pas suggérer que les mutations en cours du virus Ebola sont sans inquiétude. Au fur et à mesure que la mutation s'appuie sur la mutation, de nouvelles lignées virales peuvent être créées, dont certaines peuvent affaiblir le virus (et mettre fin efficacement à la lignée) et d'autres peuvent renforcer le virus (et promouvoir la lignée).
Ces préoccupations ont été soulignées dans une étude de 2016 Cellule dans laquelle une scission dans une lignée du virus Ebola a été identifiée en 2014 au plus fort de la crise en RDC. Selon des chercheurs de l'Université du Massachusetts, cette «nouvelle» lignée était mieux à même de se lier aux cellules hôtes que la lignée ancestrale.
Bien que ce changement n'augmente pas intrinsèquement l'infectivité du virus (principalement parce que la liaison n'est qu'une partie du processus d'infection), des mutations supplémentaires pourraient apparemment s'appuyer sur cet effet et augmenter la pathogénicité globale du virus.
De toute évidence, il n'y a aucun moyen de prédire si ou quand cela pourrait se produire. La surveillance continue est le seul moyen viable de l'éviter.
En termes simples, en réduisant le nombre de personnes exposées à Ebola (grâce à des efforts de vaccination accrus et à de meilleures mesures de contrôle de la maladie), il y a moins de possibilités de mutation. Jusqu'à ce qu'un remède soit trouvé, c'est peut-être le meilleur moyen de prévenir une épidémie mondiale.
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