Qu'est-ce que le test BRAF?

Contenu

• Objectif du test
• Risques et contre-indications
• Avant le test
• Après le test
• Interprétation des résultats

Les tests BRAF sont effectués pour rechercher des changements génétiques dans les tumeurs (altérations génomiques) qui sont présents dans certains cancers, y compris le mélanome métastatique, le cancer du poumon, le cancer du côlon et d'autres. S'il est positif, la présence d'une mutation BRAF peut aider à orienter le traitement (comme les médicaments ciblant les mutations BRAF), à estimer le pronostic, etc. Le test peut être effectué par différentes techniques, telles que l'immunohistochimie ou le profilage génétique complet, et peut être effectué sur un échantillon de tumeur ou via un test sanguin (biopsie liquide).

Objectif du test

Le test BRAF est effectué pour rechercher la présence de mutations BRAF dans une tumeur. L'oncogène BRAF code pour une protéine qui joue un rôle important dans la croissance de certains cancers. Ces mutations sont généralement acquises au cours du processus où une cellule devient cancéreuse. Dans le cadre d'un cancer, ces mutations ne sont généralement pas héréditaires.

Certaines raisons pour lesquelles les tests BRAF peuvent être effectués comprennent:

• Pour guider le traitement avec des médicaments conçus pour cibler BRAF (inhibiteurs de BRAF et MEK). Ceci est vrai pour un certain nombre de tumeurs métastatiques, mais aussi avec un mélanome de stade 3 pour guider le traitement adjuvant du mélanome.
• Pour prédire la réponse aux traitements thérapeutiques non ciblés. La présence d'une mutation BRAF peut prédire si une personne répondra à certains types de chimiothérapie, etc.
• Pour estimer le pronostic. Les tumeurs qui contiennent des mutations BRAF avaient historiquement un pronostic plus sombre que celles sans mutation, bien que cela commence à changer avec les traitements ciblant la mutation.
• Avec le cancer colorectal, pour déterminer si une tumeur est susceptible d'être héréditaire (par exemple, syndrome de Lynch) ou sporadique (non héréditaire).
• Avec certains cancers tels que le cancer de la thyroïde, pour aider à déterminer le diagnostic précis.
• Autres utilisations: le test BRAF (par biopsie liquide) peut être utilisé dans un proche avenir pour le suivi du traitement du mélanome, pour détecter les cellules cancéreuses restantes chez les personnes après une chirurgie (maladie résiduelle minimale) ou pour tester une rechute précoce.

Mutations génétiques héréditaires ou acquises

Cancers pour lesquels des tests BRAF peuvent être effectués

Des mutations BRAF se retrouvent dans un certain nombre de types de cancer différents, bien que la fréquence de ces mutations varie considérablement. Ils sont très fréquents dans le mélanome métastatique et certaines autres tumeurs. Bien que moins fréquentes dans les tumeurs telles que le cancer du poumon non à petites cellules, la recherche de ces mutations est importante car des options de traitement sont disponibles et peuvent prolonger la vie. Votre médecin peut recommander un test BRAF si vous avez:

• Mélanome (métastatique / stade 4 ou stade 3)
• Cancer du poumon non à petites cellules
• Cancer colorectal
• Cancer de la thyroïde (cancer anaplasique de la thyroïde et cancer papillaire de la thyroïde)
• Cancer de l'ovaire séreux (un type de cancer épithélial de l'ovaire)
• Autres tumeurs, telles que le lymphome non hodgkinien, certaines tumeurs cérébrales (telles que le gangliogliome et l'astrocytome pilocytique chez les enfants), le cancer de l'œsophage, etc.

Mutations BRAF dans le cancer

Lorsque le test est terminé

Idéalement, le test BRAF est effectué lorsqu'une tumeur (métastatique ou mélanome de stade 3) est diagnostiquée pour la première fois. Elle est également fréquemment pratiquée si une tumeur progresse ou métastase, car le statut BRAF peut changer. Le terme discordance est utilisé pour décrire comment une tumeur peut initialement être BRAF négative, mais devenir BRAF positive lorsqu'elle progresse. Ceci est plus facile à comprendre en réalisant que les cancers changent continuellement, développant de nouvelles mutations à mesure qu'ils se développent.

Le statut BRAF peut changer et une tumeur initialement négative au moment du diagnostic peut être positive lorsqu'elle progresse ou réapparaît.

Les types

Il existe plusieurs types différents de mutations BRAF, BRAF V600E et BRAF V600K étant les plus courants. Les mutations non BRAF V600 sont plus fréquentes dans certaines tumeurs autres que le mélanome, bien que la signification de ces autres mutations soit encore inconnue dans de nombreux cas. La présence de ces différents types est importante dans les tests, car certaines méthodes de test peuvent détecter uniquement les mutations BRAF V600E tandis que d'autres détectent une plage plus large.

Test BRAF chez les personnes sans cancer

Comme indiqué, les mutations BRAF chez les personnes atteintes de cancer sont presque toujours des mutations BRAF acquises, mais des mutations héréditaires BRAF peuvent également survenir. En outre, les mutations BRAF peuvent également être associées à d'autres conditions médicales non cancéreuses. En d'autres termes, être informé que vous avez une mutation BRAF si vous n'avez pas reçu de diagnostic de cancer ne signifie pas que vous avez un cancer (bien qu'il puisse être associé à un risque accru).

Méthodes de test

Il existe un certain nombre de méthodes de test différentes disponibles pour rechercher la présence de BRAF, et entrer dans les détails sur ces méthodes dépasse le cadre de cet article. Cependant, il existe deux types de tests distincts dont il est important de discuter car la probabilité de trouver une mutation BRAF, si elle est présente, peut varier entre ces méthodes.

• Test rapide: Certaines méthodes de test rapide ne peuvent détecter que les mutations V600E, les mutations BRAF les plus courantes trouvées avec le mélanome
• Profilage génomique complet (séquençage d'ADN): Le séquençage de l'ADN peut détecter d'autres types de mutations BRAF ainsi que des mutations ou des altérations génomiques d'autres gènes susceptibles d'affecter le comportement d'une tumeur

Les deux méthodes ont des avantages et des inconvénients, par exemple, les résultats de l'histochimie peuvent être disponibles beaucoup plus tôt, alors que le profilage génomique complet a une plus grande sensibilité dans la détection des mutations BRAF.

Cancer du poumon

Dans le cas du cancer du poumon, le séquençage de nouvelle génération est généralement effectué et, dans le cas du cancer du poumon non à petites cellules métastatique, il s'est avéré rentable et très complet. Avec le cancer du poumon, il existe un certain nombre d'autres traitements potentiellement traitables. mutations qui peuvent également être détectées, justifiant en outre des tests complets. De plus, les mutations BRAF peuvent se développer sous forme de mutations de résistance, mutations qui surviennent dans une tumeur traitée avec une autre forme de thérapie ciblée (comme les inhibiteurs de l'EGFR) afin d'échapper au médicament.

Mélanome

Avec le mélanome, le séquençage de l'ADN est l'étalon-or, bien que des tests rapides soient souvent effectués. Il existe cependant des preuves que le profilage génomique complet peut présenter des avantages (ou devrait au moins être envisagé chez les personnes dont le test BRAF est négatif avec d'autres méthodes).

Basé sur un 2019 PLoS One étude, l'immunochimie est efficace pour détecter les mutations V600E, mais les personnes qui ont des tests négatifs devraient subir des tests moléculaires pour rechercher d'autres mutations BRAF.

Une autre étude de 2019 a révélé que le profilage génétique complet (séquençage de nouvelle génération basé sur la capture hybride) était capable de détecter des altérations activatrices de BRAF dans une fraction significative de tumeurs qui avaient précédemment été testées négatives. La conclusion de cette étude était que, étant donné que la découverte de la présence de mutations BRAF peut conduire à des traitements aux bénéfices avérés, un profilage génétique complet doit être envisagé, en particulier chez les personnes dont le test initial est négatif.

Pour comparer les tests rapides, une étude de 2018 a examiné l'immunohistochimie, le test de PCR numérique par gouttelettes et la plateforme de mutation Idylla. Le test Idylla Mutation a été pensé dans une étude comme le plus approprié, car il était le plus rapide et contrairement à certains autres tests rapides, il peut identifier des mutations autres que BRAF V600E.

Tests commandés avec BRAF

Il n'y a aucun test qui remplace le test BRAF, car les tumeurs positives au BRAF et celles qui sont négatives semblent identiques au microscope.Cependant, d'autres mutations identifiées peuvent être utiles, car la présence de certaines mutations suggère généralement qu'une mutation BRAF ne sera pas présente. Les tests peuvent également fournir des informations, telles que les niveaux de PD-L1, qui peuvent être utiles pour choisir les meilleures options de traitement.

Méthodes d'échantillonnage

Le test BRAF peut être effectué sur un échantillon de tissu tumoral, via un test sanguin (biopsie liquide), ou les deux, bien que le tissu tumoral reste le «gold standard».

Test de tumeur ou test «sans biopsie»

Le test BRAF est le plus souvent effectué sur un échantillon de tissu prélevé lors d'une biopsie ou d'un retrait d'une tumeur. Cependant, cela peut poser des défis, car les procédures de biopsie pour obtenir des tissus sont invasives et même lorsqu'elles sont effectuées, il y a des moments où il n'y a pas suffisamment de tissu présent pour effectuer les tests. Étant donné que le fait de savoir si une mutation BRAF est présente peut avoir des implications importantes dans le traitement au-delà de savoir si une personne pourrait répondre à un inhibiteur de BRAF (les tumeurs qui sont négatives pour BRAF mais sont traitées avec des inhibiteurs de BRAF peuvent en fait progresser plus rapidement que si elles n'étaient pas traitées) , les chercheurs ont cherché d'autres moyens d'obtenir des résultats similaires.

Avec les tumeurs cérébrales, les tests peuvent également être effectués sur un échantillon de liquide céphalo-rachidien obtenu par ponction lombaire.

Biopsie liquide

Les tumeurs, en particulier les tumeurs plus avancées, libèrent constamment des morceaux de tumeur dans la circulation sanguine. Bien qu'il soit difficile de trouver des cellules cancéreuses entières, les chercheurs sont désormais en mesure de détecter l'ADN tumoral circulant de nombreuses tumeurs. Une fois trouvé, cet ADN peut également être testé pour les mutations et autres altérations génomiques.

Un inconvénient de la biopsie liquide est que la technique est relativement nouvelle et que toutes les tumeurs, en particulier les tumeurs à un stade précoce, ne donnent pas lieu à une circulation d'ADN qui peut être détectée.

Un avantage clair de cette méthode, cependant, est qu'elle ne nécessite qu'un simple test sanguin, et comme un test sanguin peut généralement être effectué rapidement, les résultats peuvent être disponibles plus tôt. Pour cette raison, on pense que les biopsies liquides peuvent être utilisées à temps pour surveiller de plus près un cancer. (À l'heure actuelle, nous apprenons généralement qu'une tumeur est devenue résistante à un médicament tel qu'un inhibiteur de BRAF, car on la voit se développer à nouveau sur une étude telle qu'une tomodensitométrie [TDM]. Une biopsie liquide pourrait potentiellement détecter cette résistance avant même qu'un cancer ne se développe visiblement de sorte qu'un traitement différent puisse être commencé immédiatement).

Un autre avantage d'une biopsie liquide est qu'elle permet la détection d'une mutation n'importe où dans une tumeur. Les cancers développent continuellement de nouvelles mutations, et les mutations présentes dans une partie d'une tumeur peuvent ne pas être présentes dans une autre (hétérogénéité tumorale). On sait depuis un certain temps qu'une mutation peut être présente lorsqu'une tumeur progresse, ou ne peut être trouvée que dans un site de métastase. Cela peut arriver dans une tumeur aussi. Une biopsie tumorale, en revanche, ne donnerait qu'indiquer si une mutation est présente dans la partie particulière d'une tumeur qui a été prélevée lors d'une biopsie.

Biopsies liquides dans le traitement du cancer

Cancer du poumon

Avec le cancer du poumon, une étude de 2018 a révélé que les échantillons de biopsie liquide sont aussi bons que les tests tissulaires pour détecter les mutations traitables. Dans certains cas, un changement génomique a été observé seulement sur un échantillon de tumeur ou seulement une biopsie liquide, mais en général, la corrélation était bonne. Certains oncologues recommandent maintenant de faire des tests de nouvelle génération sur tous les deux tissu tumoral et sang lors de la recherche de mutations potentiellement traitables et d'autres altérations génomiques.

Mélanome

Avec le mélanome, l'utilisation de la biopsie liquide a été moins utile (est considérée comme «inférieure») que le test tissulaire pour les mutations BRAF, mais cela peut également changer. Certains oncologues commandent désormais à la fois des tests tissulaires (lorsqu'un échantillon peut être obtenu) et une biopsie liquide (Guardant 360).

À l'appui de la biopsie liquide, une étude de 2018 a trouvé des mutations chez deux personnes atteintes de mélanome qui n'ont pas été détectées lors des tests tumoraux, et les deux patients ont répondu à un traitement ciblé.

Limites

Une limitation commune avec les tests BRAF est l'insuffisance de tissu pour effectuer les tests sur un échantillon de biopsie. On espère que les biopsies liquides pourront améliorer cette limitation dans un proche avenir.

A avec tout test de laboratoire, le test BRAF est sujet à une erreur de laboratoire.

Risques et contre-indications

Le principal risque des tests BRAF est la procédure utilisée pour obtenir l'échantillon. Cela peut varier en fonction du type de cancer, du site du cancer, de l'état de santé général d'une personne, etc. Avec la biopsie liquide (ADN tumoral circulant), le risque est similaire à d'autres prélèvements sanguins, avec un petit nombre de personnes développant des ecchymoses ou un hématome sur le site du prélèvement sanguin.

Faux positifs et négatifs

Un autre risque potentiel est que le test puisse être un faux positif ou un faux négatif. Avec un test faussement négatif, une personne qui pourrait autrement répondre aux thérapies anti-BRAF ne se verrait pas proposer ces traitements.

Les faux positifs comportent également des risques. Lorsque des tumeurs BRAF négatives (appelées «type sauvage BRAF») sont traitées avec des inhibiteurs de BRAF, elles peuvent en fait stimuler la croissance des tumeurs (les médicaments peuvent activer la voie de croissance de la tumeur), ce qui pourrait entraîner une aggravation d'un cancer. Cela peut également empêcher une personne de recevoir un traitement qui pourrait être efficace.

Avant le test

Avant que votre médecin n'ordonne un test BRAF, il voudra connaître le type de cancer que vous avez, son origine et vos antécédents médicaux. Les mutations BRAF sont plus susceptibles d'être trouvées avec certaines tumeurs que d'autres (par exemple, elles sont très fréquentes dans les mélanomes «muqueux», tels que le mélanome rectal, et moins fréquentes avec certaines autres tumeurs). Votre médecin voudra également connaître tout traitement que vous avez reçu jusqu'à présent (par exemple, avec le cancer du poumon, une mutation BRAF peut se développer après qu'une personne est traitée avec un type de médicament différent qui traite le cancer).

Votre médecin vous demandera également si le test doit être effectué sur un échantillon de tissu, un échantillon de sang (biopsie liquide) ou les deux. Si un échantillon de tissu est nécessaire et qu'il n'y a pas assez de tissu présent à partir des biopsies précédentes, une procédure de biopsie répétée peut être nécessaire. Si tel est le cas, elle discutera des risques et des avantages d'une procédure de biopsie.

Horaire

Le temps requis pour le test peut varier considérablement selon que vous avez besoin d'un échantillon de tissu ou de sang et du type de test. Avec un échantillon de tissu, si vous avez besoin d'une autre biopsie, vous devrez ajouter le temps nécessaire pour planifier et faire une biopsie au temps nécessaire pour faire des tests BRAF. Les tests rapides peuvent renvoyer des résultats en quelques jours seulement. Le séquençage de nouvelle génération, en raison du processus, peut prendre jusqu'à deux à quatre semaines avant que les résultats ne soient disponibles.

Emplacement

L'emplacement du test dépendra du fait que votre médecin a déjà du tissu tumoral (d'une biopsie ou d'une chirurgie précédente) ou si une nouvelle biopsie ou une prise de sang sera nécessaire. Une prise de sang peut être effectuée dans un cadre clinique, tandis qu'une biopsie peut nécessiter un cadre chirurgical.

Nourriture et boisson

Si vous allez subir une biopsie, il peut y avoir des restrictions avant cette procédure. Habituellement, il n'y a pas de régime spécial ou de restrictions alimentaires avant le test BRAF.

Coût et assurance maladie

Le dépistage des mutations BRAF peut être assez coûteux, et il est important de parler à votre médecin de toute dépense potentielle avant le test.

Certaines compagnies d'assurance couvrent facilement à la fois le dépistage des tumeurs et la biopsie liquide, tandis que d'autres peuvent n'en couvrir qu'un. Même lorsque la couverture est présente, cependant, une autorisation préalable peut parfois être nécessaire et vous pouvez avoir des dépenses personnelles.

Le coût variera considérablement en fonction du type de test que vous subissez ainsi que du type de cancer. Les tests rapides (tests "hot spot" qui ne recherchent qu'une ou quelques mutations spécifiques) sont beaucoup moins chers que le séquençage d'exons entiers.

Si le coût des tests BRAF est gênant, il existe des options d'assistance. Si vous avez un mélanome de stade 3 ou 4, Novartis (avec Quest Diagnostics) propose le programme de test Know Now. Ce programme fournit gratuitement des tests de biopsie (test de biopsie liquide) pour les personnes atteintes de mélanome.

Ce qu'il faut apporter

Comme pour toute visite, il est important d'apporter votre carte d'assurance. Vous devez également apporter toutes les études de laboratoire ou de pathologie qui ont été effectuées dans une clinique ou un hôpital extérieur, sauf si vous êtes certain que votre médecin y a accès.

Pendant le test

Lorsque votre médecin soumettra votre sang ou votre tissu tumoral à des tests, il devra remplir un formulaire décrivant un certain nombre de détails sur votre cancer. Elle peut vous poser des questions pour s'assurer que c'est aussi précis que possible. Vous pouvez également être invité à remplir un formulaire indiquant que vous serez responsable de toute partie du coût qui n'est pas couverte par l'assurance.

Après le test

Lorsque votre test est terminé (soit un test sanguin ou une biopsie), vous serez autorisé à rentrer chez vous lorsque vous vous porterez bien. Si vous avez eu une prise de sang, vous remarquerez peut-être des ecchymoses sur le site. Avec une biopsie, les symptômes que vous pourriez ressentir dépendront à la fois du type de biopsie et du site où elle est effectuée.

Votre médecin vous indiquera si vous devez prendre rendez-vous pour connaître vos résultats ou si vous serez appelé lorsqu'ils seront disponibles.

En attente de résultats

L'un des aspects les plus difficiles des tests BRAF (et des tests d'altérations génomiques en général) est l'attente. Avec certains cancers, des tests rapides de dépistage du BRAF peuvent être effectués et vous pouvez recevoir vos résultats dans un délai d'une semaine. Contrairement aux tests rapides pour le BRAF, cependant, les tests de séquençage d'ADN (séquençage de nouvelle génération) peuvent parfois prendre de deux à quatre semaines avant que les résultats ne soient disponibles. Ce temps n'est pas le temps de transit (par exemple, le temps nécessaire à un échantillon pour se rendre au laboratoire ou le temps nécessaire à un médecin pour examiner et examiner les résultats), mais le temps réel nécessaire pour que le test soit exécuté.

Avec le cancer du poumon, cela peut rendre les médecins et les patients très anxieux de commencer un autre traitement. Pourtant, dans certains cas, commencer un autre traitement (comme la chimiothérapie) entre-temps peut faire plus de mal que de bien. Certes, cela varie énormément, et seuls vous et votre oncologue pouvez peser les avantages et les risques d'attendre avec votre cancer particulier.

Interprétation des résultats

L'interprétation des résultats des tests BRAF dépendra de la méthode utilisée, du type de cancer et du type de mutation BRAF présente s'il y en a une.

Résultats

La façon dont vos résultats sont présentés dépendra du test particulier effectué. Avec des tests rapides, vous pouvez recevoir un résultat indiquant que la mutation est présente ou absente.

Avec le profilage ADN, un certain nombre de mutations différentes peuvent être signalées dans les résultats de votre laboratoire. La présence de certains d'entre eux peut aider votre oncologue à caractériser davantage votre tumeur, mais il y a encore beaucoup d'inconnus. Pour plusieurs mutations qui peuvent être détectées (autres que BRAF), la signification est inconnue pour le moment.

S'il s'avère que vous avez une mutation BRAF, votre médecin vous parlera des options de traitement, y compris de ce à quoi vous pouvez vous attendre en termes d'efficacité par rapport aux autres options de traitement disponibles.

Suivre

Le suivi après votre test BRAF dépendra des résultats du test et de la façon dont vous vous en sortez avec votre cancer.

Si le test est négatif

Si le test BRAF est négatif sur les tests tissulaires (selon le type de votre cancer), une biopsie liquide peut être envisagée (ou vice versa). De même, si le test BRAF est négatif sur un test rapide, un profilage génétique complet peut être envisagé.

Progression et / ou propagation de la tumeur

Pour ceux qui développent une progression de leur tumeur, ou si elle se propage à d'autres régions, des tests répétés peuvent être envisagés. Les tumeurs changent continuellement et les mutations particulières ou autres altérations génomiques qui conduire la croissance de la tumeur peut également changer. Un nouveau test est important avec le mélanome, car une tumeur qui n'était pas initialement positive à BRAF peut devenir BRAF positive à mesure qu'elle se développe.

Un changement de statut de mutation est bien connu avec le cancer du poumon non à petites cellules, et les mutations BRAF se développent souvent comme une "mutation de résistance" dans les tumeurs qui étaient positives à l'EGFR (mais négatives au BRAF) et traitées avec des inhibiteurs d'EGFR.

autres considérations

Il existe plusieurs autres considérations qui accompagnent les tests BRAF. Avec le mélanome, il existe actuellement un dilemme quant à la meilleure option de traitement pour les personnes atteintes de mutations BRAF. La thérapie ciblée (inhibiteurs de BRAF) a tendance à fonctionner pour un grand nombre de personnes, mais la résistance se développe souvent en un an.

En revanche, l'immunothérapie est efficace pour moins de personnes, mais lorsqu'elle est efficace, elle peut entraîner un temps de réponse plus long. Cette question est une question que toute personne atteinte d'un mélanome BRAF positif devrait discuter avec son oncologue. Des recherches récentes, cependant, cherchent à combiner ces thérapies (thérapie triplet) avec des résultats précoces prometteurs.

Thérapie en triplets pour le mélanome positif BRAF

Dans certains cas, obtenir un deuxième avis est très utile. De nombreux médecins recommandent d'obtenir un deuxième avis dans l'un des plus grands centres de cancérologie désignés par le National Cancer Institute, qui sont plus susceptibles d'avoir des oncologues spécialisés dans votre type spécifique (et peut-être le sous-type moléculaire) de cancer.

Un mot de Verywell

Avoir un test BRAF et attendre les résultats peut entraîner beaucoup d'anxiété. Une fois qu'une personne reçoit un diagnostic de cancer, il est très difficile de s'asseoir et d'attendre, car vous pouvez imaginer que votre tumeur se développe. Lorsque vous obtenez enfin vos résultats, il y a une autre source d'anxiété. Que fais-tu maintenant? Les nombreuses avancées dans le traitement du cancer ont heureusement apporté de nombreuses nouvelles options, mais en même temps, choisir l'option qui vous convient peut être déchirant.

Comment être votre propre défenseur en tant que patient atteint de cancer

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